专利名称 ---【 一种酶切概率辅助的肽段可检测性预测方法 】

基本信息
申请号
CN201810901107.1
申请日
2018.08.09
公开(公告)号
CN109243527A
公开(公告)日
2019.01.18
申请(专利权)人
中国人民解放军军事科学院军事医学研究院;北京蛋白质组研究中心;中国科学院数学与系统科学研究院
申请人地址
100850 北京市海淀区太平路27号
发明人
常乘;付岩;高志强;朱云平; 专利类型 发明专利
摘要
本发明公开了一种酶切概率辅助的肽段可检测性预测方法,其步骤包括:1)在所有鉴定蛋白中筛选高可信蛋白;2)构建酶切位点酶切概率预测模型训练集;3)训练酶切位点酶切概率预测模型;4)对所有高可信蛋白进行理论酶切,得到理论酶切肽段;5)预测所有理论酶切肽段的酶切概率;6)构建肽段可检测性训练集;7)训练肽段可检测性模型;8)预测其他蛋白的所有理论酶切肽段的肽段可检测性。本发明根据鸟枪法蛋白质组学流程的特点,在肽段可检测性预测过程中考虑的蛋白的酶解过程,显著提高了肽段可检测性预测的准确率。
主权项
1.一种酶切概率辅助的肽段可检测性预测方法,其步骤包括:1)从已鉴定蛋白中筛选出高可信蛋白;2)构建酶切位点酶切概率预测模型训练集,训练酶切位点酶切概率预测模型;3)对所有高可信蛋白进行理论酶切,得到理论酶切肽段;4)利用所述酶切位点酶切概率预测模型预测所有理论酶切肽段的酶切概率;5)构建肽段可检测性训练集,训练肽段可检测性模型;6)利用所述肽段可检测性模型预测设定蛋白的所有理论酶切肽段的肽段可检测性。

 

IPC信息
IPC主分类号
G16B20/00(2019.01)I
IPC分类号
G16B20/00(2019.01)I

 

法律状态信息
法律状态公告日
2019.02.19
法律状态
实质审查的生效 法律状态信息
实质审查的生效IPC(主分类):G16B 20/00
法律状态公告日
2019.01.18
法律状态
公开 法律状态信息
公开

 

代理信息
代理机构名称
北京君尚知识产权代理事务所(普通合伙) 11200
代理人姓名
司立彬

 

被引专利信息
引用阶段 被引时间 专利号 申请人 公开时间

 

被引非专利信息
引用阶段 被引时间 被引文档类型 被引文档信息
相似专利

[发明专利] 结合二级质谱和机器学习算法的蛋白质组无标记定量方法
发明人:张丽华;吴琪;梁振;曲焱焱;蒋好;张玉奎 申请日:2012-12-21

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